Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed3Q9D0L1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zbed3Q9D0L1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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