Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.8 ms