Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mms19Q9D071 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mms19Q9D071 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms