Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cmss1Q9CZT6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmss1Q9CZT6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms