Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms