Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CYI0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CYI0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CYI0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CYI0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYI0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYI0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CYI0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CYI0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CYI0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CYI0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CYI0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CYI0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CYI0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CYI0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms