Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms