Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Xrcc3Q9CXE6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Xrcc3Q9CXE6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Xrcc3Q9CXE6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Xrcc3Q9CXE6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Xrcc3Q9CXE6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Xrcc3Q9CXE6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Xrcc3Q9CXE6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Xrcc3Q9CXE6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Xrcc3Q9CXE6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Xrcc3Q9CXE6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Xrcc3Q9CXE6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Xrcc3Q9CXE6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms