Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ddx47Q9CWX9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Ddx47Q9CWX9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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