Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BccipQ9CWI3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms