Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smc3Q9CW03 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms