Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Six6os1Q9CTN5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Six6os1Q9CTN5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six6os1Q9CTN5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms