Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pard3bQ9CSB4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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