Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700029F12RikQ9CRB4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms