Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ska2Q9CR46 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms