Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Pop4Q9CR08 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop4Q9CR08 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop4Q9CR08 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms