Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifitm3Q9CQW9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifitm3Q9CQW9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifitm3Q9CQW9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifitm3Q9CQW9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifitm3Q9CQW9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifitm3Q9CQW9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifitm3Q9CQW9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifitm3Q9CQW9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms