Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rwdd1Q9CQK7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms