Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Asf1aQ9CQE6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms