Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sar1bQ9CQC9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1bQ9CQC9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms