Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ubl4bQ9CQ84 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Ubl4bQ9CQ84 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ubl4bQ9CQ84 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ubl4bQ9CQ84 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms