Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp2Q9CQ73 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms