Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mrpl49Q9CQ40 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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