Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Commd4Q9CQ02 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms