Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm3Q9CPP0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npm3Q9CPP0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms