Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trem2Q99NH8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trem2Q99NH8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms