Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NsmfQ99NF2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NsmfQ99NF2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms