Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdac9Q99N13 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms