Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramel1Q99MW3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms