Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SrrtQ99MR6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms