Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms