Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ9

Ddx50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx50Q99MJ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx50Q99MJ9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx50Q99MJ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx50Q99MJ9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms