Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr3Q99MB1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms