Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sh3bp5lQ99LH9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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