Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nmd3Q99L48 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nmd3Q99L48 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nmd3Q99L48 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nmd3Q99L48 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nmd3Q99L48 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nmd3Q99L48 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nmd3Q99L48 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nmd3Q99L48 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nmd3Q99L48 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nmd3Q99L48 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nmd3Q99L48 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms