Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q99KU6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q99KU6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q99KU6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99KU6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99KU6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99KU6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99KU6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99KU6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q99KU6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q99KU6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q99KU6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q99KU6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q99KU6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q99KU6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q99KU6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q99KU6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q99KU6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q99KU6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q99KU6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q99KU6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q99KU6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q99KU6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99KU6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99KU6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99KU6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99KU6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99KU6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99KU6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99KU6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99KU6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99KU6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99KU6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99KU6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99KU6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99KU6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99KU6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99KU6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99KU6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99KU6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99KU6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99KU6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q99KU6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99KU6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99KU6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99KU6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99KU6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99KU6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99KU6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99KU6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99KU6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q99KU6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q99KU6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q99KU6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q99KU6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q99KU6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q99KU6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q99KU6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q99KU6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q99KU6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q99KU6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Q99KU6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q99KU6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q99KU6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q99KU6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q99KU6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q99KU6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q99KU6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q99KU6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q99KU6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q99KU6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q99KU6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q99KU6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q99KU6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99KU6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99KU6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99KU6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99KU6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99KU6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99KU6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99KU6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99KU6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99KU6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99KU6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99KU6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99KU6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99KU6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99KU6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms