Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Usp11Q99K46 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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Usp11Q99K46 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Usp11Q99K46 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp11Q99K46 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp11Q99K46 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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