Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TrabdQ99JY4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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