Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms