Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pacsin3Q99JB8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms