Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ddb2Q99J79 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms