Protein–RNA interactions for Protein: Q99J23

Ghdc, GH3 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhdcQ99J23 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GhdcQ99J23 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GhdcQ99J23 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms