Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smim11aQ99J19 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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