Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Cldn16Q925N4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Cldn16Q925N4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Cldn16Q925N4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Cldn16Q925N4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn16Q925N4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms