Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1l1Q923U0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tom1l1Q923U0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1l1Q923U0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms