Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Clip1Q922J3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Clip1Q922J3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Clip1Q922J3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms