Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf7Q922B6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf7Q922B6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms