Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Slc5a4bQ91ZP4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc5a4bQ91ZP4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms