Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZF4

Ctsq, Cathepsin Q, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsqQ91ZF4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsqQ91ZF4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsqQ91ZF4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms