Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf6Q91YR7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf6Q91YR7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms